Cover Image

Docking Molekular dari Trigonella foenum-graceum sebagai Antidiabetes menggunakan Molegro Virtual Docking

Main Authors: Prasetiyo, Andri , Mumpuni, Esti , R. Tjandrawinata, Raymond
Format: Article info application/pdf Journal
Bahasa: eng
Terbitan: Pusat Studi Biofarmaka Tropika LPPM IPB; Tropical Biopharmaca Research Center - Bogor Agricultural University , 2019
Subjects:
antidiabetes
docking
fenugreek
in-silico
molegro
Online Access: http://jamu.journal.ipb.ac.id/index.php/JJI/article/view/132
http://jamu.journal.ipb.ac.id/index.php/JJI/article/view/132/66
ctrlnum article-132
fullrecord <?xml version="1.0"?> <dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"><title lang="en-US">Docking Molekular dari Trigonella foenum-graceum sebagai Antidiabetes menggunakan Molegro Virtual Docking</title><creator>Prasetiyo, Andri </creator><creator>Mumpuni, Esti </creator><creator>R. Tjandrawinata, Raymond </creator><subject lang="en-US">antidiabetes</subject><subject lang="en-US">docking</subject><subject lang="en-US">fenugreek</subject><subject lang="en-US">in-silico</subject><subject lang="en-US">molegro</subject><description lang="en-US">Trigonella foenum-graceum atau fenugreek digunakan secara luas&amp;nbsp; sebagai obat tradisional&amp;nbsp; untuk pengobatan diabetes tetapi mekanisme kerjanya masih belum jelas. Penelitian bertujuan memprediksi senyawa dalam fenugreek yang berkhasiat sebagai antidiabetes secara in-silico dengan menggunakan perangkat lunak Molegro Virtual Docking . Docking dilakukan 10 Senyawa uji dalam fenugreek yaitu 4-hidroxyisoleucine, coumarine, diosgenin, galactomannan, isovitexin, quarcetin, tigogenin, trigoneline, vitexin dan yamogenin dengan 3 reseptor yaitu sugar beet alpha-glucosidase- (PDB ID : 3W37), human dipeptidyl peptidase-4 (PDB ID : 1X70), human peroxisome proliferator activated gamma (PDB: 2PRG) serta senyawa pembanding acarbose, sitagliptin dan rosiglitazone. Dari 10 senyawa uji, galactomanann&amp;nbsp; memiliki nilai Rerank Score/RS paling rendah di dua reseptor yaitu alpha glucosidase dan peroxisome proliferator activated gamma dengan nilai berturut turut -116.56 kcal/mol dan -131.18 kcal/mol dan nilai RS acarbose -113.60 kcal/mol dan rosiglitazone -124.54 kcal/mol . Dari 10 senyawa uji, tigogenin memiliki nilai RS paling rendah direseptor dipeptidyl peptidase-4 dengan nilai RS -86.54 kcal/mol dan nilai RS sitagliptin -87.02 kcal/mol. Berdasarkan nilai RS, galactomannan diprediksi memiliki aktivitas antidiabetes yang bekerja pada reseptor alpha-glucosidase dan peroxisome proliferator activated gamma sedangkan tigogenin diprediksi memiliki aktivitas antidiabetes yang bekerja pada reseptor dipeptidyl peptidase-4.</description><publisher lang="en-US">Pusat Studi Biofarmaka Tropika LPPM IPB; Tropical Biopharmaca Research Center - Bogor Agricultural University</publisher><date>2019-06-28</date><type>Journal:Article</type><type>Other:info:eu-repo/semantics/publishedVersion</type><type>Journal:Article</type><type>File:application/pdf</type><identifier>http://jamu.journal.ipb.ac.id/index.php/JJI/article/view/132</identifier><identifier>10.29244/jji.v4i2.132</identifier><source lang="en-US">Jurnal Jamu Indonesia; Vol. 4 No. 2 (2019): Jurnal Jamu Indonesia; 74-80</source><source>2407-7763</source><source>2407-7178</source><source>10.29244/jji.v4i2</source><language>eng</language><relation>http://jamu.journal.ipb.ac.id/index.php/JJI/article/view/132/66</relation><relation>10.29244/jji.v4i2.132.g66</relation><rights lang="en-US">Copyright (c) 2019 Jurnal Jamu Indonesia</rights><recordID>article-132</recordID></dc>
language eng
format Journal:Article
Journal
Other:info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Other
File:application/pdf
File
Journal:Journal
author Prasetiyo, Andri
Mumpuni, Esti
R. Tjandrawinata, Raymond
title Docking Molekular dari Trigonella foenum-graceum sebagai Antidiabetes menggunakan Molegro Virtual Docking
publisher Pusat Studi Biofarmaka Tropika LPPM IPB; Tropical Biopharmaca Research Center - Bogor Agricultural University
publishDate 2019
topic antidiabetes
docking
fenugreek
in-silico
molegro
url http://jamu.journal.ipb.ac.id/index.php/JJI/article/view/132
http://jamu.journal.ipb.ac.id/index.php/JJI/article/view/132/66
contents Trigonella foenum-graceum atau fenugreek digunakan secara luas&nbsp; sebagai obat tradisional&nbsp; untuk pengobatan diabetes tetapi mekanisme kerjanya masih belum jelas. Penelitian bertujuan memprediksi senyawa dalam fenugreek yang berkhasiat sebagai antidiabetes secara in-silico dengan menggunakan perangkat lunak Molegro Virtual Docking . Docking dilakukan 10 Senyawa uji dalam fenugreek yaitu 4-hidroxyisoleucine, coumarine, diosgenin, galactomannan, isovitexin, quarcetin, tigogenin, trigoneline, vitexin dan yamogenin dengan 3 reseptor yaitu sugar beet alpha-glucosidase- (PDB ID : 3W37), human dipeptidyl peptidase-4 (PDB ID : 1X70), human peroxisome proliferator activated gamma (PDB: 2PRG) serta senyawa pembanding acarbose, sitagliptin dan rosiglitazone. Dari 10 senyawa uji, galactomanann&nbsp; memiliki nilai Rerank Score/RS paling rendah di dua reseptor yaitu alpha glucosidase dan peroxisome proliferator activated gamma dengan nilai berturut turut -116.56 kcal/mol dan -131.18 kcal/mol dan nilai RS acarbose -113.60 kcal/mol dan rosiglitazone -124.54 kcal/mol . Dari 10 senyawa uji, tigogenin memiliki nilai RS paling rendah direseptor dipeptidyl peptidase-4 dengan nilai RS -86.54 kcal/mol dan nilai RS sitagliptin -87.02 kcal/mol. Berdasarkan nilai RS, galactomannan diprediksi memiliki aktivitas antidiabetes yang bekerja pada reseptor alpha-glucosidase dan peroxisome proliferator activated gamma sedangkan tigogenin diprediksi memiliki aktivitas antidiabetes yang bekerja pada reseptor dipeptidyl peptidase-4.
id IOS13914.article-132
institution Institut Pertanian Bogor
institution_id 20
institution_type library:university
library
library Jurnal Jamu Indonesia
library_id 3579
collection Jurnal Jamu Indonesia
repository_id 13914
subject_area Hasil-hasil penelitian yang berkaitan dengan etnobotani dan pengetahuan lokal, eksplorasi, konservasi, domestikasi sumberdaya hayati terkait jamu, pemuliaan varietas, pengembangan Good Agricultural and Collection Practices (GACP) bahan baku jamu
Hasil-hasil penelitian terkait dengan pengembangan standar bahan baku dan produk jamu, pengembangan produk jamu
identifikasi senyawa aktif baru serta sintesisnya, mekanisme kerja bioaktivitas formula jamu
hasil studi aspek sosial dan ekonomi terkait dengan pengembangan jamu
city KOTA BOGOR
province JAWA BARAT
shared_to_ipusnas_str 1
repoId IOS13914
first_indexed 2020-06-02T03:38:36Z
last_indexed 2020-06-02T03:38:36Z
recordtype dc
_version_ 1686842432346390528
score 17.205004

Lihat Juga