Tampilan Petugas: Optimasi Ekstraksi DNA dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal

Optimasi Ekstraksi DNA dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal

Main Authors:	Wardoyo, Eustachius Hagni, Sabrina, Yunita, Suryani, Dewi, Indriawan, Ramses
Format:	Article info application/pdf eJournal
Bahasa:	eng
Terbitan:	Rumah Sakit Penyakit Infeksi Prof Dr. Sulianti Saroso , 2020
Subjects:	ekstraksi DNA feses diare kanker kolorektal
Online Access:	https://www.ijid-rspisuliantisaroso.co.id/index.php/ijid/article/view/108 https://www.ijid-rspisuliantisaroso.co.id/index.php/ijid/article/view/108/pdf

ctrlnum	article-108
fullrecord	<?xml version="1.0"?> <dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"><title lang="en-US">Optimasi Ekstraksi DNA dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal</title><creator>Wardoyo, Eustachius Hagni</creator><creator>Sabrina, Yunita</creator><creator>Suryani, Dewi</creator><creator>Indriawan, Ramses</creator><subject lang="en-US">ekstraksi DNA</subject><subject lang="en-US">feses diare</subject><subject lang="en-US">kanker kolorektal</subject><description lang="en-US">Latar Belakang: Pasien kanker kolorektal sering mengalami diare, baik itu karena konsekuensi langsung akibat penyakit, efek samping kemoterapi/radioterapi, atau karena adanya infeksi. Perubahan konsistensi feses pasien kolorektal dalam kemoterapi menyebabkan perubahan komposisi feses (jumlah sel bakteri, komposisi inhibitor) yang berbeda pada feses manusia normal. Konsekuensinya ekstraksi DNA bakterial dari feses pasien kanker kolorektal dalam kemoterapi perlu dilakukan optimasi. Tujuan penelitian untuk mendapatkan protokol DNA optimal dari feses cair pasien kolorektal. Metode: Ekstraksi DNA menggunakan Quick-DNAâ„¢ Fecal/Soil Microbe Miniprep Kit (Zymoresearch). Terdapat 3 pilihan protokol yang dilakukan, yang mana 2 protokol lainnya yang merupakan modifikasi dari protokol standar yang mengikuti prinsip: 1. Disrupsi mekanis untuk memisahkan sel bakteri dari materi feses dengan modifikasi lama sentrifugasi, 2. Proses binding DNA dengan modifikasi kecepatan sentrifugasi, 3. Proses mendapatkan DNA elusi dengan modifikasi gradien volume buffer DNA. Protokol standar diaplikasikan pada feses kontrol berpasangan usia dan jenis kelamin dan feses sampel, sedang 2 protokol lainnya diaplikasikan hanya pada feses sampel. Rasio absorbansi A260/280 â‰¥ 1.8 menggunakan Nanodropâ„¢ di aplikasikan pada konsentrasi DNA yang dinyatakan sebagai DNA murni. Pemeriksaan dilakukan sebanyak 3 kali dan reratanya dilaporkan dalam penelitian ini. Hasil: Rasio absorbansi sebesar A260/280 â‰¥1.8 didapatkan pada protocol ketiga yakni dengan rerata rasio absorbansi A260/280 1.81, sedangkan pada protokol 2 dan 3 feses sampel menunjukkan rerata rasio absorbansi A260/280 1.79 dan 1.81. Kesimpulan: Protokol ketiga dalam penelitian ini merupakan protokol optimal untuk ekstraksi DNA pada sampel feses pasien pasien kanker kolorektal paska keoterapi</description><publisher lang="en-US">Rumah Sakit Penyakit Infeksi Prof Dr. Sulianti Saroso</publisher><date>2020-07-29</date><type>Journal:Article</type><type>Other:info:eu-repo/semantics/publishedVersion</type><type>Journal:Article</type><type>File:application/pdf</type><identifier>https://www.ijid-rspisuliantisaroso.co.id/index.php/ijid/article/view/108</identifier><identifier>10.32667/ijid.v6i1.108</identifier><source lang="en-US">The Indonesian Journal of Infectious Diseases; Vol. 6 No. 1 (2020): The Indonesian Journal of Infectious Disease; 41-50</source><source>2599-1698</source><source>2354-6077</source><source>10.32667/ijid.v6i1</source><language>eng</language><relation>https://www.ijid-rspisuliantisaroso.co.id/index.php/ijid/article/view/108/pdf</relation><rights lang="en-US">Copyright (c) 2020 The Indonesian Journal of Infectious Diseases</rights><recordID>article-108</recordID></dc>
language	eng
format	Journal:Article Journal Other:info:eu-repo/semantics/publishedVersion Other File:application/pdf File Journal:eJournal
author	Wardoyo, Eustachius Hagni Sabrina, Yunita Suryani, Dewi Indriawan, Ramses
title	Optimasi Ekstraksi DNA dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal
publisher	Rumah Sakit Penyakit Infeksi Prof Dr. Sulianti Saroso
publishDate	2020
topic	ekstraksi DNA feses diare kanker kolorektal
url	https://www.ijid-rspisuliantisaroso.co.id/index.php/ijid/article/view/108 https://www.ijid-rspisuliantisaroso.co.id/index.php/ijid/article/view/108/pdf
contents	Latar Belakang: Pasien kanker kolorektal sering mengalami diare, baik itu karena konsekuensi langsung akibat penyakit, efek samping kemoterapi/radioterapi, atau karena adanya infeksi. Perubahan konsistensi feses pasien kolorektal dalam kemoterapi menyebabkan perubahan komposisi feses (jumlah sel bakteri, komposisi inhibitor) yang berbeda pada feses manusia normal. Konsekuensinya ekstraksi DNA bakterial dari feses pasien kanker kolorektal dalam kemoterapi perlu dilakukan optimasi. Tujuan penelitian untuk mendapatkan protokol DNA optimal dari feses cair pasien kolorektal. Metode: Ekstraksi DNA menggunakan Quick-DNAâ„¢ Fecal/Soil Microbe Miniprep Kit (Zymoresearch). Terdapat 3 pilihan protokol yang dilakukan, yang mana 2 protokol lainnya yang merupakan modifikasi dari protokol standar yang mengikuti prinsip: 1. Disrupsi mekanis untuk memisahkan sel bakteri dari materi feses dengan modifikasi lama sentrifugasi, 2. Proses binding DNA dengan modifikasi kecepatan sentrifugasi, 3. Proses mendapatkan DNA elusi dengan modifikasi gradien volume buffer DNA. Protokol standar diaplikasikan pada feses kontrol berpasangan usia dan jenis kelamin dan feses sampel, sedang 2 protokol lainnya diaplikasikan hanya pada feses sampel. Rasio absorbansi A260/280 â‰¥ 1.8 menggunakan Nanodropâ„¢ di aplikasikan pada konsentrasi DNA yang dinyatakan sebagai DNA murni. Pemeriksaan dilakukan sebanyak 3 kali dan reratanya dilaporkan dalam penelitian ini. Hasil: Rasio absorbansi sebesar A260/280 â‰¥1.8 didapatkan pada protocol ketiga yakni dengan rerata rasio absorbansi A260/280 1.81, sedangkan pada protokol 2 dan 3 feses sampel menunjukkan rerata rasio absorbansi A260/280 1.79 dan 1.81. Kesimpulan: Protokol ketiga dalam penelitian ini merupakan protokol optimal untuk ekstraksi DNA pada sampel feses pasien pasien kanker kolorektal paska keoterapi
id	IOS20143.article-108
institution	RSPI Sulianti Saroso Jakarta
institution_id	10818
institution_type	library:special library
library	Diklat Sulianti Saroso
library_id	8009
collection	The Indonesian Journal of Infectious Disease
repository_id	20143
subject_area	Kesehatan masyarakat Penyakit Infeksi
city	JAKARTA UTARA
province	DKI JAKARTA
repoId	IOS20143
first_indexed	2024-06-13T07:59:52Z
last_indexed	2024-06-13T07:59:52Z
recordtype	dc
_version_	1801734881183531008
score	9.9049015

Optimasi Ekstraksi DNA dari Spesimen Feses Pasien Kanker Kolorektal

Lihat Juga