MORPHOLOGY AND GENETIC DIVERSITY OF MITOCHONDRIAL DNA D-LOOP REGION USING PCR-RFLP ANALYSIS IN MAGELANG DUCK AND OTHER NATIVE DUCK

Main Authors: D, Purwantini, Tri, Yuwanta, Tetty, Hartatik, Ismoyowati, Ismoyowati
Format: Article PeerReviewed application/pdf
Bahasa: eng
Terbitan: JITA , 2013
Subjects:
Online Access: https://repository.ugm.ac.id/32406/1/28_3-B1_JITAA_Vol_38_No1_2013_p1-9_Purwantini_et_al.pdf
https://repository.ugm.ac.id/32406/
ctrlnum 32406
fullrecord <?xml version="1.0"?> <dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"><relation>https://repository.ugm.ac.id/32406/</relation><title>MORPHOLOGY AND GENETIC DIVERSITY OF MITOCHONDRIAL DNA D-LOOP REGION USING PCR-RFLP ANALYSIS IN MAGELANG DUCK AND OTHER NATIVE DUCK&#xD; </title><creator>D, Purwantini</creator><creator>Tri, Yuwanta</creator><creator>Tetty, Hartatik</creator><creator>Ismoyowati, Ismoyowati</creator><subject>Husbandry</subject><subject>Livestock</subject><description>Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh warna bulu yang berbeda terhadap keragaman morfologi itik Magelang dan keragaman genetik menggunakan analisis PCR-RFLP daerah D-loop DNA mitokondria (mtDNA) pada populasi itik Magelang dan itik lokal lainnya (itik Tegal, Mojosari, Bali dan Alabio) di Indonesia. Materi penelitian terdiri atas itik Magelang sebanyak 50 ekor dan itik lokal lainnya masing-masing 20 ekor yang diambil sampel darahnya. Karakteristik morfologi ukuran tubuh, kemampuan produksi maupun kualitas telur itik Magelang dianalisis menggunakan rancangan acak lengkap dengan sebelas macam warna bulu yang berbeda sebagai perlakuan. Teknik PCR digunakan untuk mengamplifikasi fragmen pada daerah D-loop mtDNA dan produk PCR didigesti dengan menggunakan enzim restriksi endonuklease AluI and HaeIII. Penelitian ini berhasil menunjukkan bahwa secara statistik keragaman morfologi pada populasi itik Magelang dipengaruhi oleh perbedaan warna bulu. Analisis PCR-RFLP menggunakan enzim restriksi AluI and HaeIII berhasil memperoleh enam kombinasi pola restriksi fragmen, sehingga dihasilkan enam haplotipe (A, B, C, D, E and F). Perbedaan haplotipe tersebut menunjukkan adanya keragaman genetik pada populasi itik Magelang dan itik lokal lainnya. Disimpulkan bahwa perbedaan warna bulu mempengaruhi keragaman morfologi pada populasi itik Magelang dan keragaman genetik populasi itik lokal di Indonesia dapat diidentifikasi menggunakan analisis PCR-RFLP pada daerah D-loop mt DNA.&#xD; &#xD; Kata kunci: keragaman morfologi, genetik, PCR-RFLP, D-loop mtDNA, itik Magelang </description><publisher>JITA</publisher><date>2013</date><type>Journal:Article</type><type>PeerReview:PeerReviewed</type><type>File:application/pdf</type><language>eng</language><identifier>https://repository.ugm.ac.id/32406/1/28_3-B1_JITAA_Vol_38_No1_2013_p1-9_Purwantini_et_al.pdf</identifier><identifier> D, Purwantini and Tri, Yuwanta and Tetty, Hartatik and Ismoyowati, Ismoyowati (2013) MORPHOLOGY AND GENETIC DIVERSITY OF MITOCHONDRIAL DNA D-LOOP REGION USING PCR-RFLP ANALYSIS IN MAGELANG DUCK AND OTHER NATIVE DUCK. Journal of Indonesian Tropical Animal Agriculture, 23 (1). pp. 1-9. </identifier><recordID>32406</recordID></dc>
language eng
format Journal:Article
Journal
PeerReview:PeerReviewed
PeerReview
File:application/pdf
File
author D, Purwantini
Tri, Yuwanta
Tetty, Hartatik
Ismoyowati, Ismoyowati
title MORPHOLOGY AND GENETIC DIVERSITY OF MITOCHONDRIAL DNA D-LOOP REGION USING PCR-RFLP ANALYSIS IN MAGELANG DUCK AND OTHER NATIVE DUCK
publisher JITA
publishDate 2013
topic Husbandry
Livestock
url https://repository.ugm.ac.id/32406/1/28_3-B1_JITAA_Vol_38_No1_2013_p1-9_Purwantini_et_al.pdf
https://repository.ugm.ac.id/32406/
contents Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh warna bulu yang berbeda terhadap keragaman morfologi itik Magelang dan keragaman genetik menggunakan analisis PCR-RFLP daerah D-loop DNA mitokondria (mtDNA) pada populasi itik Magelang dan itik lokal lainnya (itik Tegal, Mojosari, Bali dan Alabio) di Indonesia. Materi penelitian terdiri atas itik Magelang sebanyak 50 ekor dan itik lokal lainnya masing-masing 20 ekor yang diambil sampel darahnya. Karakteristik morfologi ukuran tubuh, kemampuan produksi maupun kualitas telur itik Magelang dianalisis menggunakan rancangan acak lengkap dengan sebelas macam warna bulu yang berbeda sebagai perlakuan. Teknik PCR digunakan untuk mengamplifikasi fragmen pada daerah D-loop mtDNA dan produk PCR didigesti dengan menggunakan enzim restriksi endonuklease AluI and HaeIII. Penelitian ini berhasil menunjukkan bahwa secara statistik keragaman morfologi pada populasi itik Magelang dipengaruhi oleh perbedaan warna bulu. Analisis PCR-RFLP menggunakan enzim restriksi AluI and HaeIII berhasil memperoleh enam kombinasi pola restriksi fragmen, sehingga dihasilkan enam haplotipe (A, B, C, D, E and F). Perbedaan haplotipe tersebut menunjukkan adanya keragaman genetik pada populasi itik Magelang dan itik lokal lainnya. Disimpulkan bahwa perbedaan warna bulu mempengaruhi keragaman morfologi pada populasi itik Magelang dan keragaman genetik populasi itik lokal di Indonesia dapat diidentifikasi menggunakan analisis PCR-RFLP pada daerah D-loop mt DNA. Kata kunci: keragaman morfologi, genetik, PCR-RFLP, D-loop mtDNA, itik Magelang
id IOS2744.32406
institution Universitas Gadjah Mada
institution_id 19
institution_type library:university
library
library Perpustakaan Pusat Universitas Gadjah Mada
library_id 488
collection UGM Repository
repository_id 2744
subject_area Karya Umum
city SLEMAN
province DAERAH ISTIMEWA YOGYAKARTA
repoId IOS2744
first_indexed 2016-09-14T18:09:37Z
last_indexed 2016-09-22T21:23:01Z
recordtype dc
_version_ 1685823242915282944
score 17.607244