Cover Image

Konstruksi dan Validasi Protokol Skrining Virtual Berbasis Struktur dengan Kode PDB 3MQE, 3NTG, dan 3LN0 untuk Penemuan Inhibitor Siklooksigenase-2 (COX-2)

Main Author: Esti Mumpuni
Format: Journal
Terbitan: Fakultas Farmasi Universitas Pancasila
Subjects:
KIMIA FARMASI
ctrlnum 86409
fullrecord <?xml version="1.0"?> <dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"><title>Konstruksi dan Validasi Protokol Skrining Virtual Berbasis Struktur dengan Kode PDB 3MQE, 3NTG, dan 3LN0 untuk Penemuan Inhibitor Siklooksigenase-2 (COX-2)</title><creator>Esti Mumpuni</creator><type>Journal:Journal</type><publisher>Fakultas Farmasi Universitas Pancasila</publisher><description>Seiring dengan tingginya penggunaan obat inhibitor COX-2 di pasaran serta efek samping yang ditimbulkan oleh obat-obat yang beredar saat ini maka penemuan obat inhibitor COX-2 baru dibutuhkan untuk mencari obat yang selektif terhadap COX-2 dan memberikan efek samping yang minimal. Salah satu metode yang efektif dan efisien untuk penemuan obat baru yaitu in silico. Telah dilakukan penelitian konstruksi dan validasi protokol skrining virtual berbasis struktur dengan kode protein PDB 3NTG, 3MQE dan 3LN0 menggunakan perangkat lunak PLANTS, SPORES, BKChem dan Open Babel untuk penemuan inhibitor COX-2 baru. Dalam penelitian ini digunakan dataset ligan-ligan aktif COX-2 dan pengecohnya (decoy) dari The directory of useful decoys (DUD) untuk validasi retrospektif protokol, yang terdiri dari 426 inhibitor COX-2 dan 13289 decoy. Berdasarkan kriteria nilai EF20% dan EFmax dalam artikel Huang et al (2006) dan Yuniarti et al (2011) dihasilkan dua protokol menunjukkan hasil yang sangat baik dan baik yaitu protokol tervalidasi AYO_COX2_v.1.1 dan AYO_COX2_v.1.2</description><subject>KIMIA FARMASI</subject><identifier>86409</identifier><recordID>86409</recordID></dc>
format Journal:Journal
Journal
author Esti Mumpuni
title Konstruksi dan Validasi Protokol Skrining Virtual Berbasis Struktur dengan Kode PDB 3MQE, 3NTG, dan 3LN0 untuk Penemuan Inhibitor Siklooksigenase-2 (COX-2)
publisher Fakultas Farmasi Universitas Pancasila
topic KIMIA FARMASI
contents Seiring dengan tingginya penggunaan obat inhibitor COX-2 di pasaran serta efek samping yang ditimbulkan oleh obat-obat yang beredar saat ini maka penemuan obat inhibitor COX-2 baru dibutuhkan untuk mencari obat yang selektif terhadap COX-2 dan memberikan efek samping yang minimal. Salah satu metode yang efektif dan efisien untuk penemuan obat baru yaitu in silico. Telah dilakukan penelitian konstruksi dan validasi protokol skrining virtual berbasis struktur dengan kode protein PDB 3NTG, 3MQE dan 3LN0 menggunakan perangkat lunak PLANTS, SPORES, BKChem dan Open Babel untuk penemuan inhibitor COX-2 baru. Dalam penelitian ini digunakan dataset ligan-ligan aktif COX-2 dan pengecohnya (decoy) dari The directory of useful decoys (DUD) untuk validasi retrospektif protokol, yang terdiri dari 426 inhibitor COX-2 dan 13289 decoy. Berdasarkan kriteria nilai EF20% dan EFmax dalam artikel Huang et al (2006) dan Yuniarti et al (2011) dihasilkan dua protokol menunjukkan hasil yang sangat baik dan baik yaitu protokol tervalidasi AYO_COX2_v.1.1 dan AYO_COX2_v.1.2
id IOS3659.86409
institution UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
affiliation fkp2tn.onesearch.id
ptki.onesearch.id
institution_id 394
institution_type library:university
library
library Perpustakaan UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
library_id 459
collection OPAC Pusat Perpustakaan UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
repository_id 3659
subject_area Islam/Agama Islam
Computer Science Education/Pendidikan Ilmu Komputer, Pendidikan Teknik Informatika
Islam dan Ilmu Sosial
Medicine and Health/Ilmu Kedokteran, Ilmu Pengobatan dan Ilmu Kesehatan
city KOTA TANGERANG SELATAN
province BANTEN
shared_to_ipusnas_str 1
repoId IOS3659
first_indexed 2018-12-31T15:54:26Z
last_indexed 2021-09-09T12:30:21Z
recordtype dc
_version_ 1748975786180739072
score 16.915823

Lihat Juga